El blanquinegro fue fundado oficialmente el 30 de agosto de 1908, por un grupo de socios con ideas innovadoras pertenecientes al "Club de Pelota", es el segundo equipo con más campeonatos locales, con un total de 20 títulos mientras que en el orden nacional es junto a Godoy Cruz y San Martín el equipo que más veces ha jugado en la Primera División de Argentina, con nueve participaciones en lo que fue el Campeonato Nacional.

En 1922, a un año de la profesionalización de la Liga Mendocina de Fútbol, Gimnasia se convirtió en el primer equipo en ganarla. El Lobo mantuvo una lucha reñida junto a quien es hoy su «clásico rival», es decir, Independiente Rivadavia quien le dio pelea hasta la última fecha del certamen ya que en esta el Blanquinegro lo derrotó por 1:0 con gol de Vicente González en el estadio de Pacífico,n. 3 y se adjudicó el primer campeonato.

Aquí los saludos por su nuevo onomástico: